大多数海绵都附在他物，如岩石面，或泥沙中的一个坚实物体上，固着在其他生物时，有时会使这些生物(如藤壶)死亡。有时海绵与所固着的生物呈互利关系，如寄居蟹壳上的皮海绵(Suberitesdomuncula)被寄居蟹带著移动，而海绵的气味使鱼和其他动物退避。海绵的表面或水管和腔中也有各种动植物生活著，有时在一个海绵中生活的有几千个生物。俪虾属(Spongicola)的幼体可进入某些海绵(如偕老同穴〔Venussflowerbasket〕)内，成长後成对地生活其中而不能游出，日本人把这些虾视为白头偕老的象徵。　

　　多孔动物的共生物中最重要的是单细胞或多细胞藻类。海绵给藻类提供保护和代谢废物，而藻类供给海绵氧气，藻死亡後也可作为海绵的食物。有的动物寄生在海绵体表或体内，如剑水蚤是海产海绵最重要的寄生虫。轮虫寄生在淡水海绵体内，水蟎在其中产卵，水蛉科(Sisyridae)幼虫生活在淡水海绵体内并以海绵为食。一般说来，肉食动物不吃海绵，因为海绵气味难闻，有硬骨针。但有的贝类(石鳖、帽贝)、甲壳类和鱼类以海绵为食。多孔动物门分3纲︰钙质海绵纲、寻常海绵纲及玻璃海绵纲(Hyalospongiae)。